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根据上海高校布局结构调整规划，为了满足我校发展的需要，改善办学条件与环境，在上海市委、市政府的直接关心和支持下，我校将整体搬迁至上海临港新城。
临港新城的规划建设，是上海市委、市政府认真落实建设上海国际航运中心国家战略的一项重大战略决策。临港新城将重点建设以国际海运为特色，集现代物流、服务、出口加工、自由贸易、金融保险、教育科研、居住生活和文化娱乐等多功能为一体，具有世界一流水平的生态型、智能型现代滨海园林港口城市。
我校新校区位于临港新城中心区西南橄榄路南侧，南接上海海事大学新校区，东至沪城环路，西至芦潮引河，占地面积1600亩，总建筑面积58.6万平方米。按照“一次规划、分期实施”的原则，新校区分四期建设，其中一、二期工程满足办学基本需要，三、四期工程满足学校远期发展需求。新校区于2006年1月12日奠基，计划于2008年8月竣工。一、二期工程竣工后初步形成新校区空间框架，基本满足办学需要。
新校区在整体布局上采用“二级学院区－公共资源区－后勤生活区”的基本布局模式，以简练质朴的建筑语言体现高校建筑舒展大气的开放性和文化性气质，色彩以黑白灰作为校园基调，体现含蓄内敛、古朴淡雅的校园气氛；同时依靠建筑细节的塑造，吸收经典欧式建筑的比例和尺度，把中国传统的建筑有机融合，力求创造“简致和美、清雅峻逸”的新历史主义建筑风格。
我校整体搬迁至临港新城，是学校融入上海高校发展战略总体部署、抓住机遇实现跨越式发展的重要机遇，是我校大力拓展办学空间、认真谋划新的发展、不断迈向新的目标的新起点。我校将以建设新校区为契机，加快学校教学科研、学科建设、师资队伍建设、人才培养等各项工作的发展，全面提升办学水平，认真处理好改革、发展、稳定的关系，切实做好新校区建设各项工作。
按照临港新城“生态城市、风景城市、旅游城市、数字城市”的要求，新校区建设规划将秉承以人为本、人与自然融合的原则，高起点规划、高标准建设。以搬迁为契机，按照“面向现代化、面向世界、面向未来”的要求，争取到2012年，建校一百周年时，把学校建设成为水产、海洋、食品等学科优势明显，农、理、工、经、文、管等多学科协调发展，科研教学并重，在国际上有重要影响的高水平特色大学，成为高级专业技术人才和高素质应用型人才培养的摇篮以及我国水产、海洋、食品等方面科技创新的重要基地。
附：新校区一、二期工程简况
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一期工程
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序号
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建筑单体名称
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建筑面积
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备注
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1
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公共教学楼
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1号楼
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13918
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2号楼
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8640
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3号楼
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11712
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4号楼
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11658
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连廊
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568
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与景观综合中
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2
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图文信息中心
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31567
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按藏书60万册
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3
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校行政楼
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11850
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含人文学院、外国语学院
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4
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教学实验楼
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23992
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生物、化学、物理、信息与计算等四个实验中心
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学生事务中心
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2557
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5
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二级学院
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生命学院
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13754
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水生系、养殖系、海生系、营养系、环境系、学院行政
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生命学院实验楼1
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4357
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中心实验室、育种系、医学系、病原库、生态室等
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生命学院实验楼2
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1262
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鱼类营养与养殖环境研究中心
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食品学院
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11457
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学科及学院行政
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食品学院实验楼
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5003
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制冷楼
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海洋学院
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7957
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工程学院、培训中心
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7892
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经贸学院
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3946
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信息学院
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5393
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爱恩学院
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5134
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6
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第一食堂
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9750
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7
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体育馆
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7937
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合计
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200304
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二期工程
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1
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本科生公寓
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120482
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满足12762人住宿
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2
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研究生公寓
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27339
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满足2006人住宿
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3
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第二食堂
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8567
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4
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第三食堂
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6069
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5
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学生活动中心
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9100
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6
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体育场
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8990
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6500座
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合计
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180547
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备注：1、数据来源：一期工程为施工图面积，二期工程为初步设计面积；
2、各建筑单体名称均为暂名，正式命名待征名确定；
3、各建筑单体面积，均以竣工验收后房产证面积为准。
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